Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms