Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms