Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms