Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm45902Q3UDN3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms