Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms