Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms