Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms