Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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