Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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