Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms