Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Col24a1Q30D77 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col24a1Q30D77 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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