Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ush2AQ2QI47 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms