Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms