Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms