Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd1Q04519 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms