Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms