Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms