Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cbx1P83917 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cbx1P83917 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cbx1P83917 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cbx1P83917 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx1P83917 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx1P83917 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms