Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ptprn2P80560 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ptprn2P80560 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ptprn2P80560 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ptprn2P80560 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ptprn2P80560 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ptprn2P80560 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ptprn2P80560 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ptprn2P80560 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ptprn2P80560 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ptprn2P80560 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ptprn2P80560 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprn2P80560 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms