Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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