Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp3P70281 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp3P70281 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms