Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps4xP62702 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms