Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ube2d3P61079 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ube2d3P61079 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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