Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms