Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms