Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcanP55066 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NcanP55066 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NcanP55066 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NcanP55066 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NcanP55066 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NcanP55066 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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