Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Tmod1P49813 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Tmod1P49813 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tmod1P49813 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tmod1P49813 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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