Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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