Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms