Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Epb41P48193 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Epb41P48193 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms