Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo1bP46735 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo1bP46735 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo1bP46735 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo1bP46735 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo1bP46735 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo1bP46735 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo1bP46735 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms