Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh15P33146 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms