Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NapbP28663 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NapbP28663 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NapbP28663 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NapbP28663 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NapbP28663 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NapbP28663 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NapbP28663 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms