Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms