Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Xrcc5P27641 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Xrcc5P27641 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Xrcc5P27641 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Xrcc5P27641 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Xrcc5P27641 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Xrcc5P27641 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Xrcc5P27641 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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