Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PdgfraP26618 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PdgfraP26618 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PdgfraP26618 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PdgfraP26618 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PdgfraP26618 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PdgfraP26618 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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