Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Znf239P24399 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Znf239P24399 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms