Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TP20293 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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