Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csn1s1P19228 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Csn1s1P19228 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Csn1s1P19228 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Csn1s1P19228 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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