Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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