Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms