Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms