Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01644 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01644 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01644 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01644 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01644 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01644 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01644 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01644 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01644 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms