Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

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Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BlmO88700 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BlmO88700 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
BlmO88700 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BlmO88700 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
BlmO88700 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BlmO88700 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BlmO88700 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BlmO88700 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BlmO88700 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BlmO88700 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BlmO88700 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BlmO88700 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BlmO88700 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BlmO88700 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BlmO88700 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BlmO88700 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BlmO88700 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms