Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms