Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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