Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdmt1O55055 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms