Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2f6O54917 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms