Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3O54890 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3O54890 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3O54890 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3O54890 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3O54890 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3O54890 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3O54890 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3O54890 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3O54890 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3O54890 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3O54890 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms