Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casq1O09165 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms